論 文 PUBLICATIONS


2019

Hamada,H., Uemoto, T., Tanaka, Y., Honda, Y., Kitajima, K., Umeda, T.,Kawakami, A.Shinya, M.,Kawakami, K., Tamura, K. and Gembu, A.(2019) Patternof fin rays along the antero-posterior axis based on their connection to distalradials.Zoological Letters(in press).

Mittal, N.,Yoon, S.-H., Enomoto, H., Miyama, H., Shimizu, A.,,Kawakami, A., Fujita, M., Watanabe, H., Fukuda, K. and Makino, S. (2019)Versicanis crucial for the initiation of cardiovascular lumen development in medaka (Oryzias latipes)Scientific Reports9, 9475. doi: 10.1038/s41598-019-45851-3.

Higashikuse,Y., Mittal, N., Arimura, T., Yoon, S.-H., Oda, M., Enomoto, H.,Kaneda, R., Hattori, F., Suzuki, T.,Kawakami, A.,Gasch, A.,Furukawa, T., Labeit, S., Fukuda, K., Kimura, A.,Makino, S. (2019) Perturbation of the titin/MURF1 signaling complex isassociated withhypertrophic cardiomyopathy in a fish model and in humanpatients.BioRxiv  doi:https://doi.org/10.1101/680579.


2018

Shibata, E. Liu, Z. Kawasaki, T., Sakai, N. and*Kawakami, A.(2018)  Robust and local positionalinformation within a fin ray directs fin length duringzebrafish regeneration.Development,Growth & Differentiation00:1–11.https://doi.org/10.1111/dgd.12558.
ヒレの長さを決める位置情報の存在とその性質を明らかにしました。

Shibata,E., Ando, K., Murase, E. and*Kawakami, A.(2018) Heterogeneousfates and dynamic rearrangement of wound epidermis-derived cellsduringzebrafish fin regeneration.Development145,dev162016.
doi:10.1242/dev.162016
ひれの再生における再生上皮を介した皮膚の再生機構。瘢痕のない完全な皮膚の再生は,基底細胞の再編成が鍵である。
プレスリリースhttps://www.titech.ac.jp/news/2018/041321.html


2017

Ando,K., Shibata, E., Hans, S., Brand, M. and Kawakami, A.Osteoblastproduction by reserved progenitor cells in zebrafish bone regenerationandmaintenance.Developmental Cell 43, 1-8.https://doi.org/10.1016/j.devcel.2017.10.015
骨を新生,再生する前駆細胞を解明しました。
プレスリリース https://www.titech.ac.jp/news/2017/039678.html

(総説) 川上厚志(2017)組織の再生には”ほどほど”の炎症が大?! ? ゼブラフィッシュを使った研究で明らかに. Academist Journal 2017年3月22日 https://academist-cf.com/journal/?p=3874


Hasegawa, T., Hall, J. C., Crosier, P. S., Abe, G., Kawakami, K., Kudo, A., Kawakami, A. (2017)Transient inflammatory response mediated by interleukin-1b is requiredfor proper regeneration in zebrafish fin fold.eLife10.7554/eLife.22716.
Doi:http://dx.doi.org/10.7554/eLife.22716
組織再生が起こるにはちょうど良いレベルの炎症が重要であることを明らかにした。炎症と組織再生の意外な関係が明らかになった。
プレスリリース  http://www.titech.ac.jp/news/2017/037577.html  

Shibata, E., Ando,K. and Kawakami, A.(2017) Transplantation of mesenchymal cells including the blastema inregenerating zebrafish fin.Bio-protocol7(2), e2109.
DOI: https://doi.org/10.21769/BioProtoc.2109
再生芽を含む間充織細胞の移植について詳細を報告した。ビデオ付き。



2016
Shibata, E., Yokota, Y., Horita, N., Kudo, A., Abe, G., Kawakami, K. and *Kawakami, A. (2016) Fgf signalling controls diverse aspects of fin regeneration.Development143, 2920-2929. 
Doi: 10.1242/dev.140699
Fgfシグナルの再生における機能を解明。傷上皮で活性化されるFgf20aが再生芽の形成を誘導し、誘導された再生芽に発現するFgf3などが細胞の増殖を指令することを解明した。
 プレスリリース  http://www.titech.ac.jp/news/2016/035781.html



2015
Hasegawa, T., Nakajima, T., Ishida, T. Kudo, A. and *Kawakami, A. (2015) A diffusible signal derived from hematopoietic cells supports 3 the survival andproliferation of regenerative cells during zebrafish fin fold regeneration.Developmental Biology  399, 80-90.  
造血細胞を欠損する変異体では、再生へと活性化された再生細胞が、増殖する代わりに細胞死を起こすことを発見した。体内の拡散性因子が、再生細胞の生存に必要なことを示した。



2012
Yoshinari, N., Ando, K., Kudo, A., Kinoshita, M. and *Kawakami, A. (2012) Colored medaka and zebrafish: Transgenics with ubiquitous and strongtransgene expression driven by the medakab-actin promoter.Development Growth & Differentiation54, 818-828.  
細胞系譜の解析を可能にするために、全身すべての細胞でDsRedを発現し、Cre組み換えで永続的にEGFP発現に変換出来るトランスジェニック系統を開発した。

Fujita, M., Mitsuhashi, H., Isogai, S., Nakata, T., Kawakami, A., Nonaka, I., Noguchi, S., Hayashi, Y. K., Nishino, I. and Kudo, A. (2012)  Filamin C plays anessential role in the maintenance of the structural integrity of cardiac and skeletal muscles, revealed by the medaka mutant zacro.DevelopmentalBiology361, 79-89.
筋萎縮モデルメダカ変異体の解析。ヒトの筋萎縮症の原因のひとつであるフィラミンCの変異。



2011
(REVIEW) Yoshinari, N. and *Kawakami, A. (2011) Mature and Juvenile Tissue Models of Regeneration in Small Fish Species.Biological Bulletin221, 62-78.
幼若組織再生モデルと成体再生モデルについての最新の知見をまとめた総説。



2010
川上厚志 (2010) 「増殖か,死か」:組織再生における増殖細胞の生存戦略、実験医学(増刊) 細胞死研究総集編28(7),159-166.
再生組織における細胞増殖とアポトーシスの制御機構について、研究の最新の知見などもまとめた総説。

Ishida, T., Nakajima, T., Kudo, A. and * Kawakami, A. (2010) Phosphorylation of Junb family proteins by the Jun N-terminal kinase supports tissueregeneration in zebrafish.Developmental Biology340, 468-479.
組織再生において、Junb, Junblと上流のキナーゼであるJNKが必須の役割を果たすことを解明した。

(REVIEW) *Kawakami, A. (2010) Stem cell system in tissue regeneration in fish.Development Growth & Differentiation52, 77-87.
組織再生における幹細胞の関与などについて論じた総説。

Taneda,Y., Konno, S., Makino, S., Fukuda, K., Imai, Y., Kudo, A. and *Kawakami, A. (2010) Epigenetic control mechanism of cardiomyocyte productionin response to a stress during the medaka heart development.Developmental Biology340, 30-40.
心室ミオシン重鎖変異体メダカの解析。心臓形成に、拍動と血流が必要なことを示した。



2009
Yoshinari, N., Ishida, T., Kudo, A., and *Kawakami, A. (2009) Gene expression and functional analysis of zebrafish larval fin fold regeneration.Developmental Biology325, 71-81. 
マイクロアレイ解析による再生関連遺伝子の同定と、変異体、阻害剤などを用いた解析。再生組織は多様な細胞からなることを示した。



2008
Parvin, M. S., Okuyama, N., Inoue, F., Islam, M. E. Kawakami, A., Takeda, H. and Yamasu, K. (2008) An Autoregulatory Loop and Retinoic AcidRepression Regulate pou2/pou5f1 Gene Expression in the Zebrafish Embryonic Brain.Developmental Dynamics237, 1373-1388. 
 
Sultana, N., Nag, K., *Hoshijima, K., *Kawakami, A., and *Hirose, S. (2008) Zebrafish Early Cardiac Connexin, Cx36.7/Ecx, Regulates MyofibrilOrientation and Heart Morphogenesis by Establishing Nkx2.5 Expression.Proc. Natl. Acad. Sci. USA105, 4763-4768.
心臓変異体ゼブラフィッシュの解析。新規のコネキシンの変異。拍動がNkx2.5発現を制御して、心筋繊維の束化を促すことを解明。
  プレスリリース  http://www.hyoka.koho.titech.ac.jp/eprd/recently/research/research.php?id=88 

Nakatani, Y., Nishidate, M., Fujita, M., *Kawakami, A. & *Kudo, A. (2008) Migration of mesenchymal cell fated to blastema is necessary for fish finregeneration.Development Growth & Differentiation50, 71-83.
メダカの尾部ひれ再生における細胞移動、Akt/PI3Kシグナルの関与を示した。



2007
(REVIEW) Nakatani, Y., *Kawakami, A. and *Kudo, A. (2007) Cellular and molecular processes of regeneration, with special emphasis on fish fins.Development, Growth & Differentiation49, 145-154. 

Mathew, L. K., Sengupta, S., Kawakami, A., Andreasen, E. A., Lohr, C. V., Loynes, C. A., Renshaw, S. A., Peterson, R. T. and Tanguay, R. L. (2007)Unraveling Tissue Regeneration Pathways Using Chemical Genetics.J. Biol. Chem.282, 35202-35210. 

Nishidate, M., Nakatani, Y., Kudo, A. and * Kawakami, A. (2007) Identification of novel markers expressed during fin regeneration by microarray analysisin medaka fish.Developmental Dynamics236, 2685-2693.  
メダカひれ再生過程におけるマイクロアレイ解析から、再生組織の新たなマーカーとなる遺伝子を同定した。



2006
Islam, M. E., Kikuta, H., Inoue, F. Kanai, M., Kawakami, A., Parvin, M. S., Takeda, H. and Yamasu, K. (2006) Three enhancer regions regulate gbx2 geneexpression in the isthmic region during zebrafish development.Mechanisms of Development123, 907-924.

Watanabe, M., Iwashita, M., Ishii, M., Kurachi, Y., Kawakami, A., Kondo, S. & Okada, N. (2006) Spot pattern of leopard Danio is caused by mutation in thezebrafish connexin41.8 gene.EMBO reports7, 893-897. 

Sakaguchi, S., Nakatani, Y., Takamatsu, N., Hori, H., Kawakami, A., Inohaya, K. and Kudo, A. (2006) Medaka unextended-fin mutants suggest a role forHoxb8a in cell migration and osteoblast differentiation during appendage formation.Developmental Biology  293, 426 - 438. 
メダカのひれ形成不全変異体の解析。Hoxb8aと下流のノンカノニカルWntシグナルが鰭条の伸展と形成を制御することを示した。

Teraoka, H., Dong, W., Okuhara, Y., Iwasa, H., Shindo, A., Hill, A. J., Kawakami, A. and Hiraga, T. (2006) Impairment of lower jaw growth in developingzebrafish exposed to 2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin and reduced hedgehog expression.Aquatic Toxicology78, 103-113.



2005
Yoshimoto, M., Chang, H., Shiota, M., Kobayashi, H., Umeda, K., Kawakami, A., Heike, T. and Nakahata, T. (2005) Two different roles of purified CD45+c-kit+Sca1+lineage- cells after transplantation in muscles.Stem Cells23, 93-102.

Murayama, E., Herbomel, P., Kawakami, A., Takeda, H. and Nagasawa, H. (2005) Otolith matrix proteins OMP-1 and Otolin-1 are necessary for normalotolith growth and their correct anchoring onto the sensory maculae.Mechanisms of Development122, 791-803.

*Kawakami, A., Nojima, Y., Toyoda, A., Ishida-Takahoko, M., Satoh, M., Tanaka, H., Wada, H., Masai, I., Terasaki, H., Sakaki, Y., Takeda, H. and *Okamoto,H. (2005) The zebrafish secreted matrix protein You/Scube2 is implicated in long-range regulation of hedgehog signalingCurrent Biology15, 480-488. 
ゼブラフィッシュヘッジホッグシグナル変異体youの解析。新たなヘッジホッグシグナル制御因子として細胞外マトリックス分子Scube2を同定した。



2004
*Kawakami, A., Fukazawa, T. and Takeda, H. (2004) Early fin primordia of zebrafish larvae regenerate by a similar growth control mechanism with adultregeneration.Developmental Dynamics231, 693-699.  
ゼブラフィッシュのふ化直後の幼生尾部を用いた新たな再生モデルを構築。成体再生と比較し、多くの共通点を持つことを示した。

Sekimizu, K., Nishioka, N., Sasaki, H., Takeda, H. and Karlstrom, R. & *Kawakami, A. (2004) The zebrafish iguana locus encodes Dzip1, a novel zincfinger protein required for proper regulation of hedgehog signaling.Development131, 2521-2532.
ゼブラフィッシュヘッジホッグシグナル変異体iguanaの解析。シグナルレスポンスを失う表現型を示し、ポジショナルクローニングから新たなヘッジホッグシグナル制御因子dzip1を同定した。

Nakano, Y., Kim, H. R., Kawakami, A., Roy, S., Schier, A. F. and Ingham, P. W. (2004) Inactivation of dispatched 1 by the chameleon mutationattenuates Hedgehog signaling in the zebrafish embryo.Developmental Biology269, 381-392.
ゼブラフィッシュヘッジホッグシグナル変異体chameleonの解析。シグナルがほとんど消失する表現型を示し、原因遺伝子解析から、リガンドの細胞外輸送に関わる膜レセプターdispatchedを発見した。



2003
Karlstrom, R. O., **Tyurina, O. V., **Kawakami, A., Nishioka, N., Talbot, W. S., Sasaki, H. and Schier, A. F. (2003) Genetic analysis of zebrafish gli1 andgli2 reveals divergent requirements for gli genes in vertebrate development. Development 130, 1549-1564.(**equal contribution)
ゼブラフィッシュヘッジホッグシグナル変異体detourの解析。原因遺伝子としてgli2の変異を明らかにした。

Yabe, T., Shimizu, T., Muraoka, O., Bae, Y.-K., Hirata, T., Nojima, H., Kawakami, A., Hirano, T., and Hibi, M. (2003) Ogon/Secreted Frizzled functions asa negative feedback regulator of BMP signaling.Development130, 2705-2716.



2002
Nikaido, M., Kawakami, A., Sawada, A., Furutani-Seiki, M., Takeda, H. and Araki, K. (2002) Tbx24, encoding a T-box protein, is mutated in the zebrafishsomite-segmentation mutant fused somites Nature Genetics31, 195199.
体節が形成されない自然発生変異体として有名なfused somitesの原因遺伝子を解明した。新規のT-box遺伝子Tbx24のナンセンス変異とfgfシグナル制御を明らかにした。


2001
Sawada, A., Shinya, M., Jiang, Y.-J., Kawakami, A., Kuroiwa, A. and Takeda, H. (2001) Fgf/MAPK signaling is a crucial positional cue in somite boundaryformation.Development128, 4873-4880.


2000
川上厚志 (2000)  ゼブラフィッシュのジェネティックスとジェノミックス、蛋白質核酸酵素45 (増刊), 2853-2863.
ゼブラフィッシュにおける変異体スクリーニングから、原因遺伝子のポジショナルクローニングによる同定までの方法についての解説。



1999
Nishina, S., Kohsaka, S., Yamaguchi, Y., Handa, H., Kawakami, A., Fujisawa, H. and Azuma, N. (1999) PAX6 expression in the developing human eye.British J. Ophthal.83, 723-727.



1998
Nomura, T., Kawakami, A., and Fujisawa, H. (1998) Correlation between tectum formation and expression of two PAX family genes, PAX6 and PAX7, inavian brains.Dev. Growth & Differ.40, 485-495.
中脳視蓋形成におけるPAXファミリー遺伝子の役割を解析。ニワトリ、ウズラ間の細胞移植を行い、脳領域分化には先だってPAX6,7発現が必要なことを示した。

Yamamoto, M., Gotoh, Y., Tamura, K., Tanaka, M., Kawakami, A., Ide, H., and Kuroiwa, A. (1998) Coordinated expression of Hoxa-11 and Hoxa-13 duringlimb muscle patterning.Development125, 1325-1335.



1997
川上厚志 (1997)  神経管の腹側における細胞の分化 ソニックヘッジホッグシグナルの2つの作用、実験医学15 (8), 918-920.

川上厚志 (1997)  NodalシグナルのコファクターOep:ゼブラフィッシュ発生遺伝学の地平、細胞工学18 (7), 1021-1023.

Ericson, J., Rashbass, A., Schedl, A., Brenner-Morton, S., Kawakami, A., von Heyningen, V., Jessell, T. M. and Briscoe, J. (1997) Pax6 controlsprogenitor cell identity and neuronal fate in the spinal cord and hindbrain in response to graded Shh signaling.Cell90, 169-180.
Pax6の発現が、ヘッジホッグシグナル勾配に応答して神経管や後脳における神経前駆細胞の運命決定に関わっていることを示した。

Kawakami, A., Kimura-Kawakami, M., Nomura, T. and Fujisawa, H. (1997) Distributions of PAX6 and PAX7 suggest their involvement in both early andlate phases of chick brain development.Mech. Dev.66, 119-130.
成熟神経細胞に発現するPAXファミリー因子としてPax6, 7を同定、詳細な発現解析を、遺伝子発現および抗体によって行った。

Fujisawa, H., Kitsukawa, T., Kawakami, A., Takagi, S., Shimizu, M., and Hirata, T. (1997) Roles of a neuronal cell-surface molecule, neuropilin, in nervefiberfasciculation and guidance. Cell Tissue Res. 290, 465-470.



1996
Ericson, J., Morton, S., Kawakami, A., Roelink, H. and Jessell, T. M. (1996) Two critical periods of Sonic Hedgehog signaling required for thespecification of motor neuron identity. Cell 87, 661-673.
神経管の背側のみに発現するPAX7をマーカーとして用い、ヘッジホッグシグナルによる運動神経の分化が段階的に起こることを示した。
 
Kameyama, T., Murakami, Y., Sutou, F., Kawakami, A., Takagi, S., Hirata, T, and Fujisawa, H. (1996) Identification of Plexin family molecules in mouse.Biochem. Biochem. Biophys. Res. Comm.226, 396-402.

Kameyama, T., Murakami, Y., Sutou, F., Kawakami, A., Takagi, S., Hirata, T, and Fujisawa, H. (1996) Identification of a neuronal cell surface molecule,Plexin, in mouse.Biochem. Biophys. Res. Comm. 226, 524-529.

Sugisaki, N., Hirata, T., Naruse. I., Kawakami, A., Kitsukawa, T. and Fujisawa, H. Positional cues that are strictly localized in the telencephalon inducepreferential growth of mitral cell axons. (1996)J. Neurobiol.29, 127-137.

Kawakami, A., Kitsukawa, T., Takagi, S. and Fujisawa, H. (1996) Developmentally regulated expression of a cell surface molecule, neuropilin, in themouse nervous system.J. Neurobiol.29, 1-17.



1995
Kitsukawa, T., Shimono, A., Kawakami, A., Kondoh, H. and Fujisawa, H. (1995) Overexpression of a membrane protein, neuropilin, in chimeric micecauses anomalies in the cardiovascular system, nervous system and limb.Development121, 4309-4318.

Ohta, K., Mizutani, A., Kawakami, A., Murakami, Y., Kasuya, Y., Takagi, S., Tanaka, H. and Fujisawa, H. (1995) Plexin: A novel neuronal cell surfacemolecule that mediates cell adhesion via a homophilic binding mechanism in the presence of calcium ions.Neuron14, 1189-1199.

Takagi, S., Kasuya, Y., Shimizu, M., Matsuura, T., Tsuboi, M., Kawakami, A. and Fujisawa, H. (1995) Expression of a cell adhesion molecule, neuropilin, inthe developing chick nervous system.Dev. Biol.170, 207-222.

Noguchi, T., Adachi-Yamada, T., Katagiri, T., Kawakami, A., Iwami, M., Ishibashi, J., Kataoka, H., Suzuki, A., Go, M. and Ishizaki, H. (1995) Insectprothoracicotropic hormone: a new member of the vertebrate growth factor superfamily.FEBS letters376, 251-256.

1994
Ishibashi, J., Kataoka, H., Isogai, A., Kawakami, A., Saegusa, H., Yagi, Y., Mizoguchi, A., Ishizaki, H. and Suzuki, A. (1994) Assignment of disulfide bondlocation in prothoracicotropic hormone of the silkworm, Bombyx mori: a homodimeric peptide.Biochemistry33, 5912-5919.



1992
Kimura-Kawakami, M., Iwami, M., Kawakami, A., Nagasawa, H., Suzuki, A. and Ishizaki, H. (1992) Structure and expression of bombyxin-related peptidegenes of the moth Samia cynthia ricini.General and Comp. Endocrinol.86, 257-268.



1991
(BOOK)  Kataoka, H., Nagasawa, H., Kawakami, A., Oka, T., Mizoguchi, A., Iwami, M., Ishizaki, H. and Suzuki, A. (1991) Bombyx prothoracicotropichormone. In Insect Neuropeptides: Chemistry, Biology and Action (Eds. Menn, J. J., Kelly, T. J. and Masler, E. P.) 3, 21-26.ACS Symposium Series453, ACS Washington, DC. 



1990
Kawakami, A., Kataoka, H., Oka, T., Mizoguchi, A., Kimura-Kawakami, M., Adachi, T., Iwami, M., Nagasawa, H., Suzuki, A. and Ishizaki, H. (1990) Molecularcloning of the Bombyx mori prothoracicotropic hormone.Science247, 1333-1335.

Iwami, M., Adachi, T., Kondoh, H., Kawakami, A., Nagasawa, H., Suzuki, A. and Ishizaki, H. (1990) A novel family C of the genes that encode bombyxin, aninsulin-related brain secretory peptide of the silkmoth Bombyx mori: Isolation and characterization of gene C-1.Insect Biochem. Mol. Biol.20,295-303.



1989
Kawakami, A., Iwami, M., Nagasawa, H., Suzuki, A. and Ishizaki, H. (1989) Structure and organization of four clustered genes that encode bombyxin, aninsulin-related brain secretory peptide of the silkmoth Bombyx mori.Proc. Natl. Acad. Sci. USA86, 6843-6847.

Iwami, M., Kawakami, A., Ishizaki, H., Takahashi, S. Y., Adachi, T., Suzuki, Y., Nagasawa, H. and Suzuki, A. (1989) Cloning of a gene encoding bombyxin,an insulin-like secretory peptide of the silkmoth Bombyx mori with prothoracicotropic activity.Dev. Growth & Differ.31, 31-37.

Adachi, T., Takiya, S., Suzuki, Y., Iwami, M., Kawakami, A., Takahashi, S. Y., Ishizaki, H., Nagasawa, H. and Suzuki, A. (1989) cDNA structure andexpression of bombyxin, an insulin-like brain secretory peptide of the silkmoth Bombyx mori.J. Biol. Chem.264, 7681-7685.



1987
Hirano, S., Nose, A., Hatta, K., Kawakami, A. and Takeichi, M. (1987) Calcium-dependent cell-cell adhesion molecules (cadherins): subclassspecificities and possible involvement of actin bundles.J. Cell Biol.105, 2501-2510.